飞船升级的核心在于蓝图强化与技术值分配。蓝图强化包含武器、护甲、动力、能源等系统模块，每升一级可获得1点技术值。技术值能自由分配至不同系统，且可通过刷新按钮无消耗重置，因此玩家需根据舰船定位灵活调整加点方案。前排抗伤舰优先强化装甲或闪避能力，输出舰侧重武器系统，工程舰则提升采集与移速效率。策略技能作为舰船被动特性，通常需消耗最多技术值激活，但能显著改变战斗表现。
其一是通过战斗或采集行动直接获取经验，但战斗经验仅能将蓝图提升至30级。其二是使用战斗数据包加速升级，这类道具可通过蓝图研究、战斗结算奖励等渠道获得。重复蓝图可兑换为技术值，为特定舰船提供定向强化资源。武器调校作为进阶强化手段，需消耗对应类型的武器技术，不同等级技术会提供2%-40%不等的成功率加成，失败时虽会消耗材料但会累积5%基础成功率直至成功。
工程船与战斗舰的升级逻辑存在差异。工程船仅需积累经验值即可提升基础性能，而战斗舰需综合考虑火力、耐久、巡航速度、抵抗伤害等多项属性。模块强化方面，武器系统建议优先调校主力舰的主武器，利用低级技术垫刀提高成功率；装甲系统需平衡护甲与能量抗性；动力系统则影响闪避与航行效率。特殊舰种如侦察型需满动力，奶船需强化锁定与命中，仓库舰则侧重仓储容量。
技术值作为稀缺资源，前期应集中投入核心舰船而非平均分配。战斗数据包建议保留给高价值舰船突破关键等级，武器技术优先用于主力输出武器调校。分舰队功能解锁后，可通过额外舰队执行采集或骚扰任务，为主力舰队节省策略值用于核心战斗。玩家需建立明确的舰船培养优先级，避免因资源分散导致关键战斗单位强度不足。
舰船定位需与舰队编组位置匹配，前排舰默认承受优先攻击，中后排则需考虑射程与生存能力。武器调校满级后可提升30%-50%攻击力，但需平衡命中与暴击属性。部分舰船拥有多个策略技能，激活顺序需结合战术需求。当基地达到高等级时，可预选生产线批量升级同类型舰船，利用分舰队机制实现多线作战，但需注意策略值消耗与补给线维护。